歴史資料の収集・整理・研究を行う専門職“アーキビスト”水鏡文彦は、美貌と頭脳を兼ね備えながらも、他人に対して容赦なく厳しい、“お猪口一杯分の器”と評される偏屈な男。そんな彼の目に留まったのは、SNSに投稿された一冊の謎の書物ーー未知の文字、奇妙な挿絵。それは、まるで「日本版ヴォイニッチ手稿」！　興味を抑えきれず、現地調査へと向かう。同行するのは、大学時代からの後輩で、健啖家かつエネルギッシュなアーキビスト・朝吹梓。
さらに、奇書コレクターにして古書店の店主、水鏡の従姉・紅子も加わり、三人は「日本版ヴォイニッチ手稿」の真相に迫っていく。奇書か？　偽書か？　「日本版ヴォイニッチ手稿」に隠された真実に迫る！